リガンド デザイナー
ヒット・トゥ・リードおよびリード最適化のための、直感的でインタラクティブな3D「リガンド 」デザイン
概要
リガンド Designerは、科学的に実証された強力かつ使いやすい3D可視化機能とリガンド 構築機能を提供します。これにより、2Dまたは3Dでリガンド の修飾を楽しく設計し、それらの変更がタンパク質-リガンド 複合体の構造にどのような影響を与えるかを容易に確認できます。3D情報の可視化に伴う複雑さを解消するリガンド Designerは、拡張現実（AR）の概念を取り入れ、新規の成長空間を含む関連情報を重ね合わせることで、リガンド の修飾が最も望ましい箇所を迅速に特定できるようにします。
リガンド Designerは、一般的な医薬化学の手法を簡単に活用できるようにすることで、3D設計プロセスを誰もが利用しやすいものにします。このツールは、Maestro およびLiveDesign でご利用いただけます。
自動化された専門ツールを使って、アイデアを簡単に設計・評価できます
完全にガイドされたワークフローを備えたインタラクティブデザイン
- 2Dおよび3D設計を自動的にドッキングする
- バイオアイソステア置換およびアイソステアスキャンを実行する
- タンパク質とリガンド との相互作用
- リガンドの環化
- 不安定な水域を特定し、排除する
- マルチ受容体 モードを使用して、選択性を最適化する
リガンド Designerのメリット
ガイド付き設計
アイデアを評価するために、手動またはガイド付きのデザインから、ご自身で最適なアプローチを選択してください。一般的な医薬品化学のワークフローが組み込まれているため、アイデアを自動的に検証でき、情報過多を回避できます。
自分だけのデザインを
2Dで設計し、workspace で構造を確認する；2½Dで設計し、結合ポケットの表示と重要な情報を確認する；あるいは、3Dで設計し、完全に制御する。
自動化された専門ツール
リガンド の変更による影響を、複雑な形状を可視化することで簡単に評価できるほか、不要な情報のノイズを低減して次のアイデアを見出すことができます。コントロールは、お客様の用途に合わせてあらかじめプログラムされています。
プロジェクトに合わせて化学をカスタマイズする
合成が容易な列挙法やR-グループ 列挙法を用いて、関心のある化学反応に合わせて調整してください。
強力な内蔵技術
Glide ドッキング、R-グループ ライブラリやPathfinderを用いた自動アイデア生成、Prime社のMacrocycle、BREED、WaterMapは、いずれもリガンド Designerで使用されています。
穏やかな海への道しるべ
SARを合理化し、活性 を推進するとともに、WaterMapを用いて「水和部位」のエントロピーとエンタルピーを計算し、選択性を調整する。
ドキュメントとチュートリアル
Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。
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