バーチャル上映_ヒーロー画像

物理学と機械学習を統合した仮想スクリーニング

物理学と機械学習を融合させた次世代バーチャルスクリーニングの必須スキルを習得し、よりスマートなヒット化合物の同定を実現する

詳細
利用可能な言語
中国語、英語、日本語、韓国語
所要時間
選択した開始日から5週間後
レベル
中級
費用
学生以外のユーザーは715ドル
学生・ポスドク:270ドル
このコースはどのような方に適していますか?
医薬品化学者、ケミインフォマティクス研究者、機械学習研究者、新進の計算化学者

概要

化学空間を探索するための計算効率の高い手法への需要が高まる中、機械学習を活用したバーチャルスクリーニングは、現代の創薬において不可欠なツールとなっています。これらの技術により、化学者は実験による検証やその後の開発に向けて、有望なヒット化合物やケモタイプを迅速に特定し、優先順位付けを行うことが可能になります。

シュレーディンガーのオンラインコース「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」では、これらのワークフローを最初から最後まで実行するための専門的な指導とベストプラクティスを提供しています。

本コースは、実践的なスキルを向上させ、リガンドベースおよび構造ベースの両アプローチに対する理解を深めたいと考える研究者にとって理想的であり、この最先端分野における専門知識を証明するための認定証とデジタルバッジも提供されます。

  • シュレーディンガー社の業界をリードする「Maestro」およびコマンドラインインターフェースを用いた、多様なターゲットを対象とした実践的な演習を通じて、研究を加速させましょう。
  • 初期の準備段階から大規模なデータ分析、そして情報に基づいた意思決定に至るまで、次世代の創薬ワークフローを包括的に実行します。
  • Active Learning Glide を使用して、仮想スクリーニングのワークフローをスケールアップします。
  • Glide WS を使用して化合物のスコアを算出し、自由エネルギー摂動(FEP+)計算から得られた結合親和性データを解析します。
  • 学んだことを包括的な実例に基づくケーススタディに応用し、高度なバーチャルスクリーニングの課題に取り組む準備が整っていることを示してください。
  • コースの課題や関連する質問について、シュレーディンガー・エデュケーション・チームの専門家による個別指導やフィードバックを受けることができます。

 

このコースには、ライセンスおよび計算リソースが完備された、SchrödingerソフトウェアのWeb版への一時的なアクセス権が含まれています。

要件
認証
  • シュレーディンガー講座の責任者が署名した修了証書(履歴書や職務経歴書に添付可能)
  • LinkedInなどのソーシャルメディアに投稿できるバッジ
背景柄

学習内容

仮想画面の実行と検証

パイロット用仮想スクリーニングを用いた実践的な体験(リガンドおよび受容体のグリッド作成など)を通じて、ドッキングシミュレーションの結果を検証するための重要な手法を学びます

ヒット評価と優先順位付け

スクリーニング後のヒットを、検査、クラスタリング、スコアリングなどを通じて、効果的に評価し、優先順位をつける方法を学ぶ

高度な手法を用いたワークフローの拡張

機械学習と自由エネルギー摂動(FEP+)手法を統合し、仮想スクリーニングのワークフローをスケールアップする方法を検討する

創薬における実用的な応用

包括的なケーススタディを通じて、仮想スクリーニングの初期設定から有望な創薬候補の評価に至るまでのエンドツーエンドのプロセスに沿って、知識を実践的に活用してください

モジュール

モジュール1
2時間

コースの概要と最新のバーチャルスクリーニング手法

動画
動画
  • コース概要
  • 講師紹介
チェックポイント
シラバスと学生行動規範

学術的誠実性に対する期待

動画チュートリアル
動画
  • シュレーディンガーのインシリコ技術
  • ヒット発見の概要
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール2
5時間+計算時間

パイロット仮想スクリーンの実行およびGlideのドッキング結果の検証

動画
動画
  • 仮想スクリーニングの基礎
  • ターゲットの有効化
  • モデルの検証
  • 化学空間
チュートリアル
チュートリアル:
  • LigPrepを用いた同族リガンドの調製
  • 受容体グリッドの生成
  • GPU形状画面
  • ドッキングモデルの最適化
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール3
5時間+計算時間

上映後のヒット評価と優先順位付け

動画
動画
  • クラスタリングおよびスコアリング手法
  • 化学的多様性とライブラリ設計
  • アクティブ・ラーニング・グライド
  • グライド WS
チュートリアル
チュートリアル
  • DISE型選択
  • SBVSおよびLBVSのヒットに対する再スコアリングと順位比較
  • AL Glideの結果を評価する:Hit Analyzer
  • 最終配合でのGlide WSの走行
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール4
4時間

機械学習とFEP+を活用したワークフローのスケーリング

動画
動画
  • ヒット候補をさらに評価・精選するための手法
  • FEP+法
  • アクティブ・ラーニング ABFEP+
  • 機械学習による不動産価格予測
チュートリアル
チュートリアル
  • AL-ABFEP+の結果の評価
  • 機械学習による予測特性を活用する
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール5
4時間+計算時間

最後の事例研究

動画
動画
  • ケーススタディの概要
  • ケーススタディの結果と講座の締めくくり
チュートリアル
チュートリアル

仮想画面の分析

課題
課題

選定されたヒット化合物に対する絶対結合性FEP+評価

コース修了
コースの修了と認定

シュレーディンガー・オンライン講座の資金調達についてサポートが必要ですか?

私たちは次世代の科学者を誇りを持って支援しており、経済的な余裕のない方々にも機会を提供することに尽力しています。学生、ポスドク、あるいは産業界の科学者として、当社のオンライン認定コースを受講するための資金援助制度についてご確認の上、今すぐお申し込みください!

卒業生の声

「バーチャルワークステーションでの体験は本当に素晴らしいものでした!医薬化学を専門とする博士課程の学生として、このコースで得た知識とスキルは、私のキャリア目標の達成に大いに役立つでしょう。」
スマイヤ・ナヒド ネブラスカ大学メディカルセンター(UNMC)大学院研究助手
「このコースは、深い理論と実際の創薬現場に即した実践的な応用を巧みに組み合わせた、専門性の高い内容でした。実践的な演習を通じて、学んだことを有意義な形で活用することができました。」
アマンディープ・シン ペンシルベニア州立大学ポスドク研究員
「この認定コースは、ハイスループット仮想スクリーニングに関する私の知識を大いに深めてくれるものであり、本格的な応用を考えている人にとっては必修のコースです。」
ウェイ・ワン アイカーン医科大学 助教
「このコースを通じて、バーチャルスクリーニングやドッキングのワークフローについて実践的な知見を得ることができ、これらの手法を自信を持って活用できるようになりました。」
フロバター・ガワルギ(ネブラスカ大学メディカルセンター 博士)
「このコースでは、バーチャルスクリーニングの手法について包括的に学ぶことができ、私の創薬プロセスを効率化するのに役立ちました。このコースは、私の研究プロジェクトの進捗と成功に直接的な影響を与えました。」
アブドゥルバシット・ハリル・ヤクブ サウサンプトン大学博士課程学生
「このコースは理解しやすく、楽しく受講できました。各手法が現代の創薬研究においてどのように評価されているかを理解できる背景知識も盛り込まれていました。今では『Maestro』の熟練ユーザーになった気がし、自信を持って分子モデリングの分野へとキャリアを向けていくことができます。」
ジョセフ・イーガン 医学研究・イノベーションセンターインターン

コースのバッジと修了証で、新たに身につけたスキルをアピールしましょう

当社の分子モデリングコースを修了し、学んだことを同僚や雇用主に共有する準備が整ったら、LinkedInのプロフィールに修了証やバッジを掲載することができます。

よくある質問

「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」のオンラインコースの受講料はいくらですか?

料金はコースごと、および受講者の区分によって異なります。本コースを受講希望の学生の方には学生料金として240ドル、学生以外の方には645ドルをご用意しています。

講義は何時からですか?

コースのセッションが開始されると、すべての講義は非同期形式となり、自分のペースで視聴できる動画、チュートリアル、課題などを都合の良い時に利用できます。コース登録時に開始日と終了日を選択します。その期間中は、コース教材や仮想ワークステーションに非同期でアクセスでき、ご自身のスケジュールに合わせて学習を進めることができます。

このコースの受講料はどうやって支払えばいいですか?

受講をご希望の方は、登録手続きを完了し、クレジットカード決済ポータルをご利用いただくことで、即座にコースのお支払いが可能です。デビットカードはご利用いただけませんので、クレジットカードが必要となります。なお、ご要望に応じて発注書を発行することも可能です。このオプションをご希望の場合は、online-learning@schrodinger.com までメールにてご連絡ください。コースのお支払い方法についてご質問がある場合は、当サイトの「支払い方法」ページをご覧ください。

登録する前に、コースの内容をどのように確認できますか?
学生向けの奨学金の制度はありますか?

シュレーディンガーは、経済的に恵まれない学生を支援することに尽力しています。シュレーディンガーの使命は、治療薬や材料の発見方法に変革をもたらすことで、人々の健康と生活の質を向上させることです。シュレーディンガーは、次世代の科学者を支援できることを誇りに思っています。当社は、経済的支援を必要としていることが証明でき、かつ指導教員からの推薦状を提出できる、フルタイムの学生またはポスドクを対象とした奨学金プログラムを設けています。 当奨学金プログラムの応募資格を満たす方は、ぜひ申請フォームにご記入ください!

コース終了後も教材は引き続き利用できますか?

コースが終了するとソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の教材の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。一方、動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみ利用可能です。

このコースを受講するには、そのソフトウェアへのアクセス権が必要ですか? ソフトウェアは別途購入する必要がありますか?

コース期間中は、Maestro、Bioluminate、Materials Science Maestro、および/またはLiveDesign(コースによって異なります)のウェブ版をご利用いただけます。ソフトウェアの利用権を別途購入する必要はありません。コース終了とともにソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の資料の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。 動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみご利用いただけます。シュレーディンガー社のソフトウェアは、コースに関連する目的でのみご利用いただくようお願いいたします。

このオンラインコースと併せて受講することをお勧めするコースはどれですか?

ターゲットの特定・準備・検証」および 高品質なリガンドライブラリの設計 のオンライン コース、「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」のオンラインコースを受講する前、受講中、または受講後に受講することをお勧めします。これらのコースはすべて密接に関連しており、同様の受講者を対象としています。 各コースには、バーチャルスクリーニング・パイプラインの各側面に関連する重要な概念が含まれているため、基礎理論に関する動画の一部が重複していることに気づくでしょう。しかし、各コースは独自の焦点を持ち、そのトピックに関連する具体的なガイダンスを詳しく解説しています。

関連コース

高品質なリガンドライブラリの設計_特集画像 ライフサイエンス ライフサイエンス
高品質なリガンドライブラリの設計

化学空間の探索、リガンドライブラリのプロファイリングと最適化、ドッキングモデルの検証、およびヒット化合物の発見に向けた列挙法

ターゲット・イネーブルメント・コースの画像_Edu_R1-2ウェブサイト_注目画像 ライフサイエンス ライフサイエンス
ターゲットの有効化、準備、および検証

X線結晶構造解析、低温電子顕微鏡法、機械学習手法、およびホモロジーモデリングによるタンパク質構造の取得を、構造ベースの計算ワークフローに活用する

FEP+を用いた創薬のためのフリーエネルギー計算 ライフサイエンス ライフサイエンス
FEP+を用いた創薬のための自由エネルギー計算

低分子化合物のリード化合物最適化に向けた、相対結合FEP+計算の実行、解析、およびトラブルシューティング