プライム
タンパク質構造 の正確な予測を実現する、強力かつ革新的なソリューション
概要
Primeは、ホモロジーモデリングとフォールド認識を単一のソリューションに統合した、完全に統合されたタンパク質構造 予測ソリューションです。Primeには、プロセスの各段階に便利なデフォルト設定を提供し、構造 予測のワークフローを段階的に案内する、直感的なステップバイステップのインターフェースが備わっています。
事例紹介とウェビナー
Schrödinger の技術が、現実の研究課題の解決にどのように活用されているかをご覧ください。
主な機能
X線結晶構造解析、NMR、または低温電子顕微鏡法によって得られた実験構造を精緻化し、その後のシミュレーションに向けた正確かつ詳細な出発点とする
実験的な構造 が利用できない場合、配列からタンパク質構造を正確に予測し、高品質なモデルを取得する
側鎖の位置を予測・精緻化し、完全な全原子タンパク質モデルを構築する。
マクロサイクルの膜透過性と立体構造を予測する
MM-GBSAを用いて、対象となるエネルギー系を迅速に計算する
構造 による予測のワークフロー全体を、ユーザーに段階的に案内する直感的なインターフェースを活用してください
配列同一性が低い、あるいは全くない場合において、初期の構造解析や機能アノテーションのためのバックボーンモデルを作成する
FEP+ と緊密に連携し、数千ものタンパク質変異を迅速にスクリーニングすることで、タンパク質の最適化に向けた正確かつ徹底的なスクリーニングプロセスを可能にします。
ドキュメントとチュートリアル
Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。
出版物
関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。