Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

Glide

業界をリードするリガンド-受容体 ドッキングソリューション

創薬における構造生物学の影響力を拡大する

正確で汎用性の高いドッキングプログラムを活用して、リガンド による創薬探索をさらに強化しましょう

Glide これは、リガンド-受容体 による信頼性の高いドッキングを実現する、業界をリードするソリューションです。本ソリューションは、バーチャルスクリーニング、結合様式の予測、インタラクティブな3D分子設計など、幅広い用途において、構造 に基づく創薬設計を強化・加速します。

「Glide 」が「リガンド 」に与える利点 -受容体 ドッキング

使いやすいグラフィカルインターフェース

シンプルでガイド付きのグラフィカルユーザーインターフェースを使用して、ドッキングモデルを簡単に作成・検証できます

さまざまな受容体 タイプにわたって高いドッキング精度を実現

低分子、ペプチド、マクロサイクルなど、多種多様な受容体 タイプにおいて、高い濃縮度を実現します

カスタマイズ可能な制約条件

幅広い制約条件を活用することで、実験で観察された要件や望ましい条件を満たすよう、ドッキング計算の方向性を容易に調整できます。化合物空間

必要に応じて、明示的な水のエネルギー計算を活用する

Glide WS を使用して、正確なポーズ予測を実現し、誤検知による仮想ヒットを排除します。

背景柄

バーチャルスクリーニングを強化するための、複数のスコアリングワークフローが含まれています

Glide SPは、ハイスループットな仮想スクリーニング向けに設計された、広く利用されている高精度なドッキングワークフローです。Glide SPは、大規模スクリーニングに最適な階層型フィルタ技術を採用しており、迅速かつ正確なヒット候補を導き出します。

Glide WSは、WaterMapによる明示的な水分子ダイナミクスを活用した高度なドッキングツールです。Glide SPおよびWScoreを基盤として構築されたGlide のWSは、結合ポケット内における低分子化合物のサンプリングおよびスコアリング性能を大幅に向上させています。

Glide Schrödingerの最新のバーチャルスクリーニングワークフローにおける重要な要素です

創薬分野における強力な活用事例

インタラクティブな3Dデザイン

リガンド Designerにおいて、目標指向型のリガンド 設計ワークフローを活用し、3D空間でインタラクティブに設計およびドッキングを行い、 LiveDesign

姿勢予測

リガンド のポーズを正確に予測し、受容体 との相互作用を把握するとともに、ABによる再スコアリングのための初期ポーズを提供します。 FEP+

バーチャル上映会

プロジェクトのニーズに合わせてカスタマイズ可能な自動化されたワークフローを用いて仮想スクリーニングを実施し、アクティブラーニングによって強化されたGlide を活用して、超大規模ライブラリ(10億化合物以上)のスクリーニングを加速します。

共有結合ドッキングとスコアリング

受容体 に共有結合で結合するリガンドのセットを、あらかじめ定義された反応化学またはカスタム反応化学を用いてドッキングする – CovDock

Glide WSを使用した再採点

WaterMapによる詳細な水溶液解析結果を組み込み、タンパク質とリガンド の結合相互作用を評価するとともに、Glide SPスクリーニングにおける偽陽性を低減する

以下の用途には、既製の商用ライブラリを活用して、計算時間と労力を節約しましょう。Glide

Schrödinger 当社は、主要なプロバイダーと提携し、数百万から数十億に及ぶ化合物からなる、フラグメント、リード様、ニア・ドラッグ様、およびドラッグ様化合物の商用データベースへのアクセスを支援しています。これらは、広範な化合物空間 を網羅しています。

MCule
PWuXi-AppTec
シグマ・アルドリッチ
MolPort
エナミン

事例紹介とウェビナー

Schrödinger の技術が、現実の研究課題の解決にどのように活用されているかをご覧ください。

ライフサイエンス ウェビナー

GenerativeGlide :実世界の創薬プロセスを記録するためのAI駆動型超大規模仮想スクリーニング

スライドの説明にとどまらず、ワークフローのデモを実施し、GenerativeGlide がセットアップから結果の表示に至るまで、実際にどのように機能するかを紹介します。ぜひご参加ください。

ライフサイエンス ウェビナー

Schrödinger デジタル創薬セミナー:Into the Clinic ~計算化学がもたらす創薬プロセスの変貌~ 第19回

RNAおよびDNAを標的とする分子の発見と最適化に向けた計算戦略

ライフサイエンス ウェビナー

Schrödinger デジタル創薬セミナー:Into the Clinic ~計算化学がもたらす創薬プロセスの変貌~ 第18回

Schrödinger スイートを活用した創薬のための低温電子顕微鏡(cryoEM)構造解析の実現

ライフサイエンス ウェビナー

Schrödinger スイートを活用した創薬のための低温電子顕微鏡(cryoEM)構造解析の実現

創薬において、タンパク質構造の重要性と価値は、分子特性を合理的に最適化できる能力に直結している。

ライフサイエンス ウェビナー

Schrödinger デジタル創薬セミナー:Into the Clinic ~計算化学がもたらす創薬プロセスの変貌~ 第15回

水の重要性:水のエネルギー学からの知見を活用した創薬初期段階の強化

ライフサイエンス ウェビナー

水の重要性:水のエネルギー学からの知見を活用した創薬初期段階の強化

このウェビナーでは、結合ポケット内の水のエネルギー動態を明示的に活用して創薬設計を強化する2つの技術、すなわち「WaterMap」と「Glide WS」がもたらす影響について解説します。

ライフサイエンス 事例研究

新規なFEP+ 戦略を用いた、高選択性かつアロステリックなピコモル級TYK2阻害剤の設計

ライフサイエンス ウェビナー

最新の仮想スクリーニング技術 シュレーディンガー・デジタル・プラットフォームを活用した現代的な仮想スクリーニング

ライフサイエンス ウェビナー

「予測優先」パラダイム:デジタル化学が創薬の未来をどう形作っているか

ライフサイエンス ウェビナー

 Schrödinger デジタル創薬セミナー:Into the Clinic ~計算化学がもたらす創薬プロセスの変貌~  

AI/機械学習を活用したアクティブラーニングとAbsolute Binding FEP+を用いた新しいバーチャルスクリーニング手法、および最新の創薬研究事例をご紹介します。

ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

リガンド のポーズを低温電子顕微鏡(Cryo-EM)モデルから精緻化し、以下を実現するFEP+

リガンド のポーズを、低温電子顕微鏡(cryo-EM)の密度マップを用いて精緻化し、FEP+ のような下流の計算を実行します。

ライフサイエンス チュートリアル

学習パス:環状ペプチドのモデリング

創薬における環状ペプチドのためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

Generativeを用いた超大規模ライブラリのスクリーニングGlide

生成型機械学習アプローチを用いて、10億規模のライブラリを24時間でスクリーニングする。

ライフサイエンス チュートリアル

BioLuminateを用いた酵素工学

OYEファミリーに属するアルケンレダクターゼの変異が、酵素の安定性およびリガンド との結合に及ぼす影響を調査する。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:オリゴヌクレオチドのモデリング

創薬における核酸関連のツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

低分子 – オリゴヌクレオチドのドッキングGlide

受容体 グリッドを生成し、共結晶リガンドおよび同族リガンドをドッキングさせ、結果を分析する。

ライフサイエンス ドキュメント

Glide

使いやすく、信頼性の高いリガンド と受容体 のドッキング機能。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:バーチャルスクリーニング

バーチャルスクリーニング・パイプラインの構築方法に関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

GlideXtal および Phenix/OPLS を用いたタンパク質-リガンド の結晶構造の精製

GlideXtalを使用して、クリスタル構造 内でリガンド の姿勢を再ドッキングし、微調整します。

ライフサイエンス チュートリアル

構造- 以下の技術を用いたバーチャルスクリーニングGlide

受容体 のグリッドをドッキング用に準備し、分子をドッキングさせ、ドッキング後の姿勢を検証します。

関連商品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる関連の計算技術について、詳しくご覧ください。

アクティブ・ラーニングの活用例

機械学習を活用して発見を加速させる

LiveDesign

デジタル分子設計のための総合ラボ

既製の商用ライブラリ

購入可能な化合物の、完全に整備されたデータベース

FEP+

創薬のための高性能な自由エネルギー計算

出版物

関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。

ライフサイエンス 出版物

Glide WS:ドッキング精度およびバーチャルスクリーニングに関する方法論と初期性能評価

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Glide WS:ドッキング精度および仮想スクリーニングに関する方法論と初期性能評価

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コンピュータ支援による創薬を通じて、SARS-CoV-2メインプロテアーゼに対する高活性の非共有結合性阻害剤を発見

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生成AIと物理ベースのアクティブラーニングフレームワークを融合させた創薬設計の最適化

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低分子化合物を用いたRNAを標的とするインシリコ・ヒット発見ワークフローの実現

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Drugit:非ペプチド性VHL結合分子のクラウドソーシングによる分子設計

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キノコ「Amaropostia stiptica」から味覚に基づいて単離された苦味成分は、ヒトの苦味受容体の一部を活性化させる

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計算機シミュレーションによる、食品着色料ビオラセインによる食源性真菌アスペルギルス・フミガトゥスの抑制メカニズムに関する分子的知見の解明

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ステビオール・レバウディオサイドは、ヒトの甘味受容体受容体 (T1R2/T1R3)複合体の4つの異なる部位に結合しており、これが実験結果の矛盾を説明している

ライフサイエンス 出版物

化学生物学における機械学習のデータ不足問題を解決する手段としてのFEPによるデータ拡張

トレーニングとリソース

オンライン認定コース

実践的なオンライン分子モデリング講座で、スキルをさらに向上させましょう。これらの講座は自分のペースで学習でき、幅広い科学的なトピックを網羅しているほか、Schrödinger ソフトウェアの利用権とサポートも含まれています。

チュートリアル

プロジェクトを成功に導くために、Schrödinger ソフトウェアの技術とベストプラクティスを導入する方法をご確認ください。トレーニングリソース、チュートリアル、クイックスタートガイド、動画などをご利用いただけます。