リリースノート

低分子創薬

プラットフォーム環境

Maestro グラフィカルインターフェース

• Bunsen–Maestro の連携：Maestro とBunsenを互いのインターフェースから起動し、アクティブなセッションを接続する
• Bunsen-Maestro の統合：新しい自動モードダイアログハンドラーにより、Maestro で実行されるエージェント主導のワークフローが、ポップアップダイアログによってブロックされることがなくなります。
• Maestro からLiveDesign へのエクスポート性能の大幅向上：大規模データセットにおけるMaestro からLiveDesign へのエクスポート性能が大幅に高速化されました。約75,000個の化合物について、処理時間が約1時間から4分未満に短縮されました。
• 構造 階層におけるポリマーを考慮した残基 のグループ化：ポリマー鎖内の非標準および修飾された残基 は、現在、その親となる生体高分子鎖（タンパク質、DNA、またはRNA）内で配列順に従ってグループ化されるようになった
• ウェルカム画面にお気に入りのプロジェクトや構造を固定する：ウェルカム画面で最近使用した項目に星印を付けると、セッションをまたいでお気に入りのプロジェクトや構造が画面上部に固定されたままになります
• UIをデフォルト設定にリセット：「環境設定」→「一般」に新しい「環境設定のリセット」セクションが追加され、「UIをデフォルト設定にリセット」という操作により、プロジェクトファイルや科学的なオプションを変更することなく、ウィンドウのレイアウト、ツールバー、色、フォント、プリセットを復元できます。
• 粗視化系における原子部分電荷の無効化：原子電荷が関係しない粗視化（CG）モデルにおいて、Maestro の原子部分電荷オプションを無効化
• 2Dビューアの設定と水素表示の制御を分離：グローバル設定とは独立して、2Dビューアの歯車メニューに専用の「2D設定…」オプション（セッション間で設定が保持される）を追加したほか、「すべて水素を表示」のトグルスイッチを追加しました
• 2D「構造 」の設定範囲を明確化：[設定] → [2D]構造 では、プロジェクトテーブルおよび2Dオーバーレイ全体にわたる適用範囲が明示的に指定され、リガンド の検出設定へのショートカットが提供され、2Dオーバーレイがこれらの設定に従うよう保証されています。

インフラ

• Apple Siliconのネイティブサポート（macOS ARM64）：macOS上のスイート全体において、x86_64への変換をARM64ネイティブバイナリに置き換え、Maestro および統合バックエンドがRosetta 2を使用せずにApple Silicon上でネイティブに実行できるようになりました。

ターゲット 検証と構造 イネーブルメント

タンパク質の調製

• 水素／結合順序の割り当て設定のカスタマイズがより簡単になりました
• タンパク質精製中に、末端のキャッピングをインタラクティブに行うことを許可する
• 入力に末端酸素が欠けている場合、それを再構築できるようになりました構造

予測毒性パネル

• 3つの新しい標的が追加されました。これには、1つの核内ホルモンである受容体 （プロゲステロン）、1つのGPCR（CB1）、および1つのプロテアーゼ（MALT1）が含まれます。

結合部位および構造 解析

Desmond 分子動力学

• シミュレーション相互作用図（SID）において、ヌクレオチド系受容体（DNA/RNA）のサポートを追加しました。
• POPE-POPG（3:1）用の新しい膜二重層テンプレート

Desmond 分子動力学

• 水素質量再分配（HMR）の調整機能を搭載し、シミュレーション速度を最大約66％向上
• System Builderでは、新たに7種類の混合脂質二重層がサポートされるようになりました

リガンド 準備

リガンド 準備と構造の生成

• LigPrep にリングスピアの検出機能を追加し、環を貫通する結合を持つマクロサイクルの立体構造が返されないようにした

実測データおよび量子力学に基づくpKa の予測

• Macro-pKa の計算終了時に、改良されたHTMLレポートが利用可能になりました。

ヒット同定およびバーチャルスクリーニング

Glide

• 「GenerativeGlide 」を活用すれば、生成AIと物理ベースのドッキングを組み合わせることで、従来のスクリーニングに比べてごくわずかな時間で数十億もの分子をスクリーニングし、多様で高スコアのヒット化合物を迅速に発見することができます。

マクロサイクル

• Macrocycle Dockingスクリプトは、低温電子顕微鏡（cryo-EM）の密度マップへのドッキングに対応するようになりました
• 新しいマップ入力フィールドにより、マクロサイクル・ドッキング・パネルを使用して、リガンドをクライオ電子顕微鏡（cryo-EM）の密度マップにドッキングできるようになりました。
• マクロサイクル・ドッキングジョブの出力ポーズでは、元の入力リガンド のタイトルが保持されるようになりました

ABFEP

• ハイスループットなABFEPスキャンモードにより、構造的に多様なケモタイプや新規スケルトンを、最大5倍の速度で効率的にスクリーニングできます。
• 溶媒系からの代表的な構造 が、現在入手可能となりました
• 必要に応じて、別の水モデルを適用する

リードの最適化

リガンド アライメント

• 「Tug Align 2」は、Maestro （リガンド ）の「アラインメント」パネルにおいて、マクロサイクルリガンド のアラインメントを行うデフォルトのアルゴリズムとなりました。
• リガンド のアライメントパネルでは、マクロサイクルのアライメントをより細かく制御するための高度なアライメントオプションが利用可能になりました。

RetroSynth

• RetroSynthのレポートが更新され、以下の内容が追加されました：
• 概要とベクター画像が掲載された表紙
• 結果の生成が高速化され、ファイルサイズも小さくなります
• トップ30だけでなく、クリアしたすべてのルート
• RetroSynthを起動する前に、カスタムベンダーから選択してください
• 新しい立体化学スコアリングは、カスタムストックの立体化学的変異を考慮に入れています

FEP+

• 溶媒系からの代表的な構造 が、現在入手可能となりました
• ヌクレオチド系受容体（DNA/RNA）のサポートを追加しました

タンパク質 FEP

• 溶媒部門の代表者である構造 が、現在ご利用いただけます
• pH依存性の親和性予測の設定および解析に対応した新しいインターフェース
• FEP+ 残基 スキャン機能では、非標準アミノ酸を含むタンパク質の変異を大規模に解析できるようになりました

FEPの溶解度

• 水分補給セクションの代表的な構造 が、現在入手可能になりました

FEP+ プロトコルビルダー

• ヌクレオチド系受容体（DNA/RNA）のサポートを追加しました

量子力学

• DFT 単一点エネルギー計算および幾何最適化は、GPU上で同一性近似の範囲内で実行可能です
• 波長に応じた旋光性は、Jaguar パネルにおける新たな特性である

マクロサイクル

• 「Tug Align 2」のオープンベータ版をリリースしました。これは、標準的なフレキシブルアラインメントでは不適切なマクロサイクルやその他の「ルール・オブ・ファイブ」の範囲を超える化合物を高速にアラインメントするための、改良されたフレキシブルリガンド アラインメントアルゴリズムです。
• Prime-MCS による天然型に近い大環状化合物のコンフォーマーの濃縮効率の向上
• Prime Macrocycleのサンプリングパネルにおけるデフォルトの暗黙的溶媒モデルは、現在、表面一般化ボーンモデルとなっています。
• QMスコアリングジョブの実行時における、マクロサイクル・スコアリングスクリプトのメモリ使用効率の改善

教育コンテンツ

• 新チュートリアル：AutoTS を用いた反応障壁に対するウォーターワイヤー効果の検討
• 新チュートリアル：マクロサイクルの親和性最適化FEP+
• 新チュートリアル：タンパク質-タンパク質複合体のインシリコ多変数最適化
• 新チュートリアル：クライオ電子顕微鏡（Cryo-EM）モデルからリガンド のポーズを精緻化し、以下を実現するFEP+
• 更新された学習パス：計算機を用いたターゲット 解析

Quantum ESPRESSO用GUI

製品：Quantum ESPRESSO (QE) インターフェース

• Quantum ESPRESSO 7.6 へのアップグレード
• POSCARファイルを入力として使用する場合のVASP制約の保持（コマンドライン）
• NEB計算におけるBroyden最適化のサポート（コマンドライン）
• (+MATSCI_QE_SOLVATION) 3D-RISMのサポート
• 表面エネルギー：スラブ表面の終端群を選択するオプション

欠陥の特性

製品名：MS DefectPro

• 欠陥補正：すべてのOSにおけるフレイゾルト補正のサポート

マイクロキネティクス

製品名：MS Microkinetics

• 電気触媒反応のための多段階ワークフロー

アクティブ・ラーニング：光電子工学

製品名：アクティブ・ラーニング・オプトエレクトロニクス

• アクティブラーニング・オプトエレクトロニクス：幾何学的最適化のためのMLFFオプション

反応性

製品名：MS Reactivity

• Reaction Network Viewer：エネルギー関連のプロパティ一覧の拡充

KMC チャージ・モビリティ

製品名：MS Mobility

• KMC電荷移動度の計算：ゼロ磁場移動度の予測精度の向上

反応性インターフェースシミュレータ

製品名：MS RIS

• 固体電解質界面：アルゴリズムの改善により処理速度が最大4倍に向上

フォースフィールドの高度な応用

製品：MS FF アプリケーション

• MLFFの計算：最適化パスに沿って返される出力構造
• MLFFの微調整：複数のデータセットを用いた学習のサポート
• MLFFの微調整：カスタムMPNICEモデルから微調整を開始するオプション
• MLFFの微調整：検証セットの割合をカスタマイズするオプション
• MLFFの微調整：他のMLFFシミュレーションのデータを用いて学習を行うオプション

分子動力学シミュレーションを用いた輸送計算

製品名：MS Transport

• イオン伝導度：入力として固体構造のサポート

粗視化（CG）分子動力学

製品名：MS CG

• バックマッピング：タンパク質構造において二次構造 が保持されている
• バックマッピング：中間構造および軌跡を記録するオプション
• バックマッピング：抗体のサポート
• Coarse-Grained Sketcher：編集用のCG構造の読み込み機能のサポート
• CG FF Builder：NPTアンサンブルがデフォルト設定として設定されています
• CG FF Builder：RDF計算の処理速度とメモリ使用効率を改善
• CG FF Builder：全原子軌道とCG軌道のトレーニング比率の制御
• 粗粒度マッピング：コマンドラインからのマッピングのサポート

材料情報学

製品名：MS Informatics

• 機械学習における物性：無機結晶の物性に関する5つの新しいモデル
• MPNICE Embeddings：ファイルシステムから読み込むオプション
• MPNICE Embeddings：選択可能な6つの新しい機械学習モデル
• MLFFの計算：並列シミュレーションのサポート
• Solubility ML：非水溶媒における分子の溶解度の予測

処方 ML

製品名：MS Formulation ML

• モデル学習の最適化：CSV出力の返却
• 製剤 ML：個々の製剤について報告された特徴量の重要度

Denovo ML

製品名：MS Denovo ML

• REINVENT：事前学習済み機械学習モデルへのアクセス
• 逆分子設計：ターゲット な特性を持つ有機分子を生成するためのAIを活用したワークフロー

MSMaestro のビルダーとツール

• Agentic Workflow：メタワークフローを構築するためのAIエージェント
• スペースの割り当てグループ ：対称性の許容誤差を設定するオプション
• 不規則系：構成要素の名称を原子レベルのプロパティとして保持する
• スラブのインポート：半導体用途向けの追加スラブ表面モデル（49個）
• インフラストラクチャ：入力SMARTS パターンの可視化
• Interface Builder：プリミティブ以外のスラブ面を作成するオプション（コマンドライン）
• Meta Workflows: (+META_WORKFLOW_QE) Quantum ESPRESSO のサポート
• Meta Workflows：熱伝導率のサポート
• 部分濃縮：元の項目タイトルの後にラベルが付けられた混合物の成分
• 周期的な列挙：エワルド順位の酸化数を設定するオプション
• 定期的な列挙：出力構造体の数を制限するオプション
• 定期的な列挙：処理速度向上のために、スペースグループ の割り当てを無効にするオプション
• 定期的な列挙：処理速度向上のためにアトム接続を無効にするオプション
• Reaction Path Viewer：MLFFのサポート
• 半結晶性高分子：反復単位上のヘッド／テール部位を割り当てるためのUI
• 半結晶性ポリマー：非晶質領域に複数のモノマー種が存在する
• 半結晶性ポリマー：処理速度を最大20倍高速化する改良アルゴリズム
• 溶媒和系：MLFFのサポート
• 溶媒和系：成分の名称を原子レベルのプロパティとして保持
• 構造化液体：構成要素の名称を原子レベルのプロパティとして保持
• Structured Liquid：MLFFへの対応
• Sugar Builder：グリコシル化パターンを用いた構築オプション

古典力学

• Droplet：MLFFへの対応
• 混合エンタルピー：(+MATSCI_MIXING_ENERGY) 複数のGPUを用いた並列計算のサポート
• 混合エンタルピー：(+MATSCI_MIXING_ENERGY) 多成分高分子材料の混合エネルギーおよびフロリー・ハギンズ χ パラメータを計算するためのワークフローソリューション
• ポリマーの架橋：処理速度向上のための改良型構造 走査アルゴリズム
• アンブレラ・サンプリング：ジョブの再開・延長のサポート
• RNAの3D分子構造 を修正するためのスクリプト（コマンドライン）

量子力学

• QM Multistage：単一点エネルギーおよび形状最適化におけるGPUサポート
• QM Multistage：波長関数としての光学回転を計算するオプション
• 吸着エネルギー：0.01 atm未満の圧力をかける場合のサポート
• 吸着エネルギー：気体中の分子に対するPBC内の真空度の上昇phase
• 吸着エネルギー：双極子補正を含めるオプション
• 結合およびリガンド の解離：解離させる結合を指定するオプション
• CREST：MSMaestro ライセンスで実行可能
• 光電子フィルムの特性：すべての入力分子について双極子を計算するオプション
• 光電子フィルムの特性：巨大表面電位（GSP）
• 光電子フィルムの特性：自発配向分極（SOP）
• 光電子フィルムの物性：電気双極子モーメントの秩序パラメータ
• オプトエレクトロニクス：MLFFによる形状最適化の支援
• Phase 図：表示単位のユーザーによる設定
• プローブグリッドスキャン：ケージ状分子の内部を調査するための機能

教育コンテンツ

• 新チュートリアル：Agentic AIモデルを用いたワークフローの設計
• 新チュートリアル：薄膜の自発的配向分極と巨大表面電位
• 新チュートリアル：電気触媒反応のマイクロキネティックモデリング
• 新チュートリアル：タンパク質の特性評価：第3部
• 新チュートリアル：パスステアード拡散モデルを用いた新規化合物のデ・ノボ設計
• 新チュートリアル：Sugar Builder を使ったグリカンの構築
• 新チュートリアル：機械学習による溶解度予測
• 新チュートリアル：無機結晶の物性予測における機械学習
• 更新されたチュートリアル：キネティック・モンテカルロ（KMC）による電荷移動度

教育コンテンツ

ライフサイエンス

• 新チュートリアル：AutoTS を用いた反応障壁に対するウォーターワイヤー効果の検討
• 新チュートリアル：マクロサイクルの親和性最適化FEP+
• 新チュートリアル：タンパク質-タンパク質複合体のインシリコ多変数最適化
• 新チュートリアル：クライオ電子顕微鏡（Cryo-EM）モデルからリガンド のポーズを精緻化し、以下を実現するFEP+
• 更新された学習パス：計算機を用いたターゲット 解析

材料科学

• 新チュートリアル：Agentic AIモデルを用いたワークフローの設計
• 新チュートリアル：薄膜の自発的配向分極と巨大表面電位
• 新チュートリアル：電気触媒反応のマイクロキネティックモデリング
• 新チュートリアル：タンパク質の特性評価：第3部
• 新チュートリアル：パスステアード拡散モデルを用いた新規化合物のデ・ノボ設計
• 新チュートリアル：Sugar Builder を使ったグリカンの構築
• 新チュートリアル：機械学習による溶解度予測
• 新チュートリアル：無機結晶の物性予測における機械学習
• 更新されたチュートリアル：キネティック・モンテカルロ（KMC）による電荷移動度

LiveDesign

2026-4年の今後の予定

• 生物学的製剤

  • 「残基 」の置換ツールで、「Paste Multiple Monomers…」機能を使用すると、複数のモノマーを一度に貼り付けることができます。モノマーデータベースに見つからない記号は無効としてマークされるため、それらを修正または削除することができます。リストを作成するには、「Monomer Database」の「Symbol」列の見出しにある「Copy」をクリックし、リストされているモノマー記号を1行につき1つずつクリップボードにコピーしてください。

  • 生成された仮想生物製剤の「エンティティ登録担当者」および「エンティティ登録日」の各列に、残基 の置換処理を誰が、いつ実行したかを記録する

  • 残基 の置換結果を、新しいLiveReportか既存のLiveReportのどちらに保存するかを選択できます。また、結果が追加された際に「ターゲット 」LiveReportを開くオプションも用意されています。

  • バナーに表示される一般的なエラーメッセージではなく、残基 の置換が失敗した具体的な理由を確認できます。選択された各モノマーについて、配列に結合するために必要な結合点がチェックされ、このチェックに失敗したモノマーや不明なモノマーが報告されます。

  • 残基 の置換結果をより簡単に比較できるようになりました。各セル内で「チェーン」、「位置」、「ソース」、「宛先」残基 の値が整列されるため、各置換が列ごとに揃います。また、アップグレード時に既存の結果列が自動的に変換されるため、以前の実行で得られた整数の「変異位置」値に小数点以下（例：5.0）が表示されることはなくなりました。

  • Entity Builder で、4つの新しいテンプレート（PDC (ペプチド | ペイロード)、PDC (ペプチド | スペーサー | ペイロード)、PDC (ペプチド | リンカー | ペイロード)、PDC (ペプチド | スペーサー | リンカー | ペイロード)）を使用して、ペプチド医薬品コンジュゲートを作成します。

  • 柔軟なテンプレートを用いた抗体薬物複合体（ADC）の登録：「ADC（抗体 | リンカー | ペイロード）フレキシブル」および「ADC（抗体 | リンカー | ペイロード）フレキシブル」テンプレートでは、単特異性または二重特異性抗体と、1つ以上のリンカー・ペイロードを指定でき、各構成要素について、必要に応じて結合に関するメタデータを追加することができます。

  • 2-Partおよび3-PartのADCテンプレートでは、モノスペシフィック抗体またはビスペシフィック抗体のいずれかを使用してください。各サブコンポーネントについて、許容されるエンティティタイプが記載されています。

  • 「追加」ボタンでリンカー・ペイロードなどの繰り返し可能なコンポーネントを追加し、削除アイコンで余分なインスタンスを削除できます。ただし、常に少なくとも1つのインスタンスは残されます。

  • エンティティビルダーの上部に表示される組み込みの指示に従って、テンプレートタイプを選択し、「選択から取得」を使用してサブコンポーネントを追加してください。テンプレートはサーバー上で管理者によって管理されており、テンプレートが設定されていない場合は、管理者に連絡するよう求めるメッセージが表示されます。

  • 「モノマーデータベース」テーブルおよびモノマーの詳細画面で、モノマーのR基を表示するとともに、モノマーの総数と、現在のフィルタ条件に一致するモノマーの数を表示します。

  • モノマースケッチャーで独自のモノマーデータベースを使用できます。独自のモノマーは、その天然アナログに応じて色分けされ、モノマーピッカーでモノマーを長押しすると、その天然アナログが表示されます。

  • 「残基 」の表示形式が選択されている場合、シーケンスビューアのロゴプロット上で、非標準モノマーはそれぞれのモノマーDB記号（最大6文字）で個別に表示されます。また、ロゴの高さとモノマーの出現頻度との関連性を把握しやすくするため、背景には控えめな色合いが用いられています。

  • シーケンスビューアで、シーケンスをアルファベット順、または1つ以上のアラインメント位置における残基 の類似度順に並べ替えることで、関連するバリアントを素早くグループ できます。並べ替え条件は保存され、ツールを再度開いた際に復元されます（以前のバージョンでLiveReportの列として保存された並べ替えは、再度適用する必要があります）。また、並べ替えの処理中はバナーが表示されます。

  • 新しい「環状ペプチドアラインメント」オプションを使用して、環状ペプチドのアラインメントを行ってください。このオプションでは、アラインメントを行う前に各配列を参照配列に最もよく一致するように回転させるため、結果が各環の直線化位置に左右されることはありません。この機能は、phase から外れた、適度に相同性のある環状ペプチドに対して最も効果的です。

  • アラインメントされた環状ペプチドの開始位置（残基 ）を設定するには、ルーラー上の「残基 」を右クリックし、「Set as First残基 」を選択します。この際、現在のアラインメントが保持されることを説明するダイアログが一度だけ表示されます。

  • 「シーケンスビューア」のツールチップで詳細を確認できます。これには、非標準の残基 に対するモノマーデータベースの完全な記号や、残基 プロパティに基づいて色分けを行う際の各残基のプロパティ値などが含まれます。

  • 「アラインメントおよびスコアリング設定」という名称に変更されたセクションで、類似度マトリクスの設定を確認できます。このセクションには、このマトリクスがペアワイズアラインメント、環状ペプチドアラインメント、および残基 の類似度ソートに使用されることを説明する情報ツールチップが表示されています。

  • シーケンスビューアで、閉じる可能なバナーを通じてエンティティが表示できない場合（たとえば、シーケンスがないエンティティや、HELMが無効なエンティティなど）を把握しておく

  • Sequence ViewerのCDRフィルタリングにおいて、ヘビーチェーンとライトチェーンを切り替える際も、ドメインの選択を一定に保つ

  • シーケンスビューアのツールチップとロゴプロットは、ツールチップのラベルの間隔が均一になり、下のオプションを覆い隠さなくなったカスタムマトリックスツールチップ、および参照配列の上部に余白が設けられたことで、より読みやすくなりました。

  • 「生物製剤／その他」エンティティのインポート（全ユーザー）：すべてのユーザーが「生物製剤／その他」のインポートタブからエンティティやデータをインポートでき、どのユーザーも既存のエンティティにデータを追加できます。また、そのエンティティのメタデータを上書きできるのは、そのエンティティの作成者または管理者のみです。

  • 通知バーから開いた詳細なインポート受領書で、生物製剤／その他のエンティティのインポート失敗を確認し、それを CSV ファイルとしてダウンロードしてください

• 低分子化合物

  • ファイルから公開済みのアッセイデータをインポート：管理者がこの機能を有効にすると、LiveDesign のUIから低分子データをインポートする際（SDF、CSV、Maestro 、Excel）、[アップロードしたデータを公開]オプションが表示されるようになります。これにより、インポートされたデータは、元のLiveReportだけでなく、すべての制限のないプロジェクトで利用可能になります。

  • プロジェクトダッシュボードの「プロジェクト管理」タブで、管理者としてプロジェクトのスキャフォールドの順序を変更します。確認後、新しい順序に基づいて「R-グループ 」分解パネルでのスキャフォールドの優先順位が設定され、プロジェクトのスキャフォールドを使用しているLiveReportsにおいて、「R-グループ 」分解が再実行される場合があります。

  • 大規模なサーバー上で「プロジェクトダッシュボードのエンティティ」ページの読み込みを高速化するため、各セクションごとに部分読み込み機能を採用し、最近のエンティティのフィルタをデフォルトで「先月」に設定し、エンティティ数を読みやすい形で表示するようにしました。

  • LiveReport から低分子のジェネリックエンティティ構造を、[フィルター] パネル、[詳細検索] の「構造 」クエリ、および [デザイン] タブと [検索] タブ内のスケッチャーにドラッグします。

  • MDL SD（Mol V3000）形式で汎用エンティティとしてインポートされた、通常の化合物に一致する低分子化合物をコピーする

• SAR 分析ダッシュボード

  • 新しい「SAR分析ダッシュボード」でSARを分析しましょう。ツールパネルの「構造・活性相関（SAR）」カテゴリからこのダッシュボードを開くと、R-グループ の分解結果を2次元ヒートマップ上にマッピングでき、任意の数値特性に応じて色分けされます。また、リンクされた「一致した骨格」および「R-グループ 」フィルターパネルも併せて表示されるため、活性の急激な低下や未探索の置換基の組み合わせを特定することができます。

  • R-グループ の分解を持つLiveReportsで、その骨格に少なくとも2つのR基団が含まれている場合、初回起動時に即座にデータを表示します。ダッシュボードは、最初に一致した骨格を選択し、R1とR2を軸に配置し、最初の数値列に基づいて色分けを行い、残りのR基団を（定義済みの）フィルターとしてAND条件で組み合わせたものを追加します。

  • 「構造 」の画像が表示され、LiveReportのフィルター適用後も表示されている行の値のみが一覧表示されるドロップダウンから、「一致するスキャフォールド」および「R-グループ 」でフィルタリングします。選択内容はダッシュボードの表示にのみ適用され、LiveReport自体には適用されません。

  • ダッシュボードから直接、軸と「色分け対象列」を変更できます。R-グループ のフィルターは自動的に切り替わるため、1つの列が軸とフィルターを兼ねることはありません。「一致したスキャフォールド」を変更すると、R-グループ のフィルターが「(定義済み)」にリセットされ、「色分け対象列」を選択すると「色分けルールの編集」ダイアログが開きます。

  • ヒートマップ、スプレッドシート、およびその他のプロットやフォーム間で、エンティティごとの行レベルで選択内容を同期する

  • 前回の状態から再開：同じLiveReportのダッシュボードを再度開くと、同じブラウザタブ内で、前回の軸、[Color By]、フィルタ値、およびヒートマップの設定が復元されます。ページを更新したり、タブを閉じたり、LiveReportを切り替えたりすると、これらの設定はリセットされます。

  • 読み込み中、エラー、およびデータなしのメッセージをクリアします。また、フィルターに一致する化合物がない場合は、フィルターを更新するよう促すメッセージも表示されます。

• あらすじ

  • 2Dヒートマップ・マトリックスプロットをさらに詳しく見てみましょう。このプロットは、数値またはカテゴリ型の属性をX軸とY軸に配置し、データの密度や第3の属性に基づいてグリッドに色を付けるもので、現在、ズーム、パン、およびセル内の値ラベルの表示/非表示の切り替えに対応しています。

  • 東側のペインとフォームビューの両方で、軸選択ツールの横にある「色を選択」列を選択し、「色付けルールを編集」オプションを使用して2Dヒートマップの色をカスタマイズします。

  • 2Dヒートマップマトリックスプロットにおいて、新しい「選択されたエンティティのみ」オプションを使用して、選択されたエンティティのみをプロットします

  • 2Dヒートマップのツールチップには、集計モード、データポイント数、集計値などの集計詳細が表示されます。数値以外の列で色分けを行う場合、集計のドロップダウンは使用不可となり、新しいヒートマップの名称はデフォルトで「2Dヒートマップ」となります。

  • 2Dヒートマップにおけるグレーのセルとセルの制限について：[Color By] レジェンドの下にある注記には、着色範囲外の値はグレーで表示されると説明されており、プロットがセルの制限（デフォルトは2,500セル、管理者が設定可能）を超えた場合は、データセットをフィルタリングするよう求めるメッセージが表示されます。

  • [データ] タブにある新しい「カテゴリデータを並べ替える」オプションを使用すると、プロットを LiveReport の並べ替え順序から独立させることができます。このオプションはデフォルトでオンになっており、散布図、折れ線グラフ、ボックスプロット、ヒストグラム、円グラフ、2D ヒートマップマトリックスプロットにおいて、カテゴリを自然な順序で並べ替えます。このオプションをオフにすると LiveReport の行順序が使用され、円グラフやヒストグラムでは、カスタムビンが定義した順序のまま保持されます。

  • 1Dヒートマッププロットは、いつでも利用可能になったため、いつでもご活用ください

  • 散布図の「サイズによる分類（Size By）」オプションで、「色による分類（Color By）」および「Shape による分類」と整合性のある列を検索します

  • 散布図上のエラーバンドは、データポイントの色を変更することなくデータポイントの背後に表示され、bandHighError および bandLowError のラベルは表示されなくなりました。

  • プロットの軸の列ピッカーにおける列名のツールチップが、画面上に固定されたままになったり、列の選択の妨げになったりすることがなくなりました。

• システム状態診断ツール

  • システムの健全性を一目で確認：ツールパネルでは「システム健全性」ツールがデフォルトで有効になっており、各メトリクスのステータスが、色覚に配慮したステータスカラーを用いて、それぞれ独立したコンパクトなタイルに表示されます。

  • 新しい「データ統合」セクションでデータ統合状況を監視できます。このセクションの「DIステータス」タイルには、同期ステータス（「同期済み」、「進行中」、「停止中」、または「失敗」）と、最後に完了した同期の時刻が表示されます。また、「保留中のDIイベント」タイルには、まだ処理待ちのイベント数が表示されます。データ統合のステータスを取得できない場合、これらのタイルにはエラーが表示されますが、ツールのその他の機能は引き続き動作します。

  • タスクキューの負荷を追跡する：キューに入っているタイルは、利用可能なワーカーごとのキュー入りタスク数を表し、実行中のタイルは稼働率を表しており、各タイルには負荷率と稼働率の値が表示されています。

  • 各タイルに表示されるステータスの閾値を確認できます。ツールチップには、現在のステータスと閾値の説明が表示されます。

  • 各タスクキューの「キュー深度の経時変化」チャートで、キュー深度の履歴を表示します。ピーク値と平均深度が表示され、時計に合わせて表示される記憶された時間範囲セレクター（過去1時間、2時間、または4時間）により、すべてのユーザーが同じ時間間隔を確認できるようになっています。

  • 管理者として、メモリ使用量および各タスクキューの「警告」および「重大」のしきい値を設定し、どのセクションをどの順序で表示するかを指定して、ツールをカスタマイズします。

  • ツール自体が利用できない場合は、次のように表示されます。「LiveDesign 」のステータスタイルに「ダウン」ではなく「不明」と表示され、他のタイルはグレーアウトされ、問題が解決しない場合は管理者に連絡するよう求めるメッセージが表示されます。

  • ツールの見出しの横にある新しい「？」アイコン、またはツールメニューの「ヘルプ」オプションから、ドキュメントを開きます。

• 3D可視化

  • 残基 の色付けと、残基 による原子の電荷表示。正電荷を持つ残基 は青、中性である残基 は黄色、負電荷を持つ残基 は赤で表示される。この表示方法はアミノ酸残基 に適用されるが、保存済みシーンには反映されない。

  • ツールバーのアイコンは、サイズを統一し、間隔を狭くして再設計されました

  • 「コンテンツ」パネル内の長い名称のツールチップは、ウィンドウ内に収まり、長いテキストは改行され、コントラストの高い背景色が使用されます。

• 検索とフィルタ

  • 関連するフィルタークエリを組み合わせるためにフィルタークエリグループを作成し、各グループ をプロパティ、親、または子で一致するように設定し、同じLiveReportフィルター内でグループと個別のフィルタークエリを組み合わせて使用します。

  • GPUSimilarityツール（ベータ版；サーバーで有効にするにはSchrödinger サポートまでご連絡ください）での部分構造による検索：[Substructure]タブを開き、LiveReportからクエリを取得するか、スケッチャーで描画し、[Search]をクリックして一致するベンダー化合物を検索します。検索結果には、[Export results]と[Show results lines]が重ねて表示され、LiveReportに名前を付けるエクスポートオプションと、下線が引かれた最大検索結果数が表示されます。

  • 「データと列」ツリーの「LiveReport」タブで、複数の単語を指定して列を検索し、すべての単語に一致する列のみを表示します

  • 「詳細検索」の「複合クエリ」ビューに追加された新しい「すべて削除」ボタンを使って、すべての条件を一括で削除できます。

• Maestro 統合：Maestro からエクスポートした3DポーズをLiveDesign に保存し、新しい構造 に対して新しいエンティティを登録するか、既存のエンティティの新しいポーズとして追加する

• UXの改善

  • 行メニューから、LiveReport内のすべての複合行を一度に展開または折りたたむ

  • ブラウザのタブに現在のプロジェクト名を表示することで、 LiveDesign のタブを見分けやすくする

  • 大規模なLiveReportを確実に複製できるようになりました。同じプロジェクト内でのLiveReportのコピー処理は、タイムアウトすることなくバックグラウンドで実行されるようになったためです。

  • 「新しいLiveReport」ダイアログでは、ネストされたフォルダをより簡単に見つけられるようになりました。このダイアログでは、ネストされたフォルダはデフォルトで展開され、親フォルダの下に完全なフォルダ名が表示されます。

  • 「マトリックス」および「マルチエンティティ・マトリックス」ウィジェットでは、キーボードを使用してマトリックスの構成グリッドを操作できます。「Tab」キーと矢印キーでセル間を移動し、「Esc」キーで編集をキャンセルします。また、列を選択すると、フォーカスがその下のセルに移動します。

  • 「エンティティのコメント」という新しい列で、既存のエンティティのコメントを確認できます。この列は「データと列」ツリーから追加可能です。コメント列は、デフォルトで従来のコメントに置き換わります。

  • 「用量反応曲線」ツールでは、選択されている行がない場合、空のプロットを表示するのではなく、1つ以上の行を選択するよう促します。

  • リガンド リガンド デザイナーでは、結合順序、原子価、または電荷が不正な構造に対して、最小化処理中に1つのエラーメッセージが表示されます。

  • 「Assay Viewer」などのツールは、LiveDesign のアップグレード後も、ブラウザのキャッシュをクリアしなくても正常に読み込まれます

• LDClientAPI

  • 新しいメソッド（list_entity_templates、get_entity_template_by_name、create_entity_template、delete_entity_template など）を使用して、エンティティビルダーのテンプレートを管理し、テンプレートの作成、一覧表示、閲覧、削除を行います。create_entity_template_version は、テンプレートの定義が変更された際に新しいバージョンを作成し、update_entity_template はその説明とフォルダパスのみを編集します。

  • LDClient を使用して、コメント形式のフリーフォーム列の値を読み取り、管理する

  • モデルの出力を、同じ名前の新しい出力に置き換えると、update_model が正常に完了します

修正された点

詳細検索

• 「詳細検索」において、クエリ「グループ 」およびクエリ式が無効な状態で追加された条件は、式が修正されると、LiveReportの更新時に失われることなく保存されるようになりました。

• 「詳細検索」の「複合検索」ビューでは、クエリ間のAND/ORロジックが定義される前であっても、空のクエリ「グループ 」を展開することができます。

• 詳細検索：「複合」ビューで括弧を追加すると、以前はパネルが「簡易」ビューに戻り、すべてのクエリが「AND」で結合されていましたが、現在は「複合」ビューのまま、指定した「AND」や「OR」の組み合わせが維持されるようになりました。

• 「登録日から過去X日以内」で検索すると、同日の早い時間に登録された化合物が検索対象から外れてしまうため、現在は指定された期間内のすべての化合物が検索結果に表示されるようになりました。

• 「詳細検索」パネルの複合ビューでは、グループ 内のクエリについて、クエリ条件を削除して新しい条件を追加した後、正しく編集および削除できるようになりました。以前は、変更内容が反映されませんでした。

• 「フリーフォームコメント」列の「詳細検索」クエリの自動更新機能は、行単位（ロットごと）モードから行単位（実験ごと）モードに戻した際に LiveReport を更新していなかったが、現在はモードが変更されるたびに結果が正しく更新されるようになった。

• 実在（または仮想）の化合物に限定した構造 クエリによる詳細検索では、構造 が他の種類の化合物にも多数一致した場合、予想よりも少ない検索結果が返されることがありましたが、現在はすべての一致する化合物が返されるようになりました。

• 「詳細検索」パネルにおいて、パネル内にスクロールが必要なほど多くのクエリが含まれている場合、直前のクエリに対応する歯車メニューが完全に表示されるようになりました。

• 「日付」フリーフォーム列での詳細検索は、一部のサーバー構成ではエンティティが一切返されませんでしたが、現在は検索範囲内の値を持つすべてのエンティティが返されるようになりました。

• 「詳細検索」の「複合ビュー」で、クエリが空の状態のグループ にある「+」アイコンをクリックしても、列オプションが開きませんでしたが、現在は、空のグループ に「+」ボタンが表示され、これをクリックすると列ツリーが開くようになりました。

• 「詳細検索」の「複合ビュー」において、クエリーグループ内の条件間で設定されたAND/OR論理が、LiveReportsを切り替えた後に消えてしまうことがありましたが、現在はLiveReportsを切り替えたりブラウザを更新したりしても保持されるようになりました。

• 以下の機能を備えたサーバーでは ENABLE_ASYNC_AUTO_UPDATE_ADVANCED_SEARCH 有効化されている場合、自動更新機能付きの高度な検索を含むLiveReportを複製しても、アッセイ実行前に検索が終了しても、高度な検索の行が失われることはなくなりました。複製時には、保存された高度な検索の行が引き継がれるようになりました（エンティティ限定の複製の場合、複製対象のエンティティにフィルタリングされた状態で）。この機能を無効にしているサーバーでは ENABLE_ASYNC_AUTO_UPDATE_ADVANCED_SEARCH 一時的な対処法として、これを再度有効にすることができます。

フィルター

• クエリで「AND」と「OR」の論理演算を組み合わせた場合、複雑な「フィルター」ビューでは、編集のたびにカーソルが消えていましたが、現在は編集中もカーソルがそのまま表示されるようになりました。

• 複雑なフィルターエディタにおいて、クエリ入力領域の外で数字を入力しても、既存のクエリ条件が式に追加されることはなくなりました。エディタでは現在、英字（A-Z、a-z）と括弧のみを受け付けます。

• 「化合物 」構造 フィルターを、フィルタースイッチをオフにした状態で削除すると、LiveReport に余分なハイライトされたサブ構造列が残ってしまう可能性がありました。このため、フィルターの変更が保存されている間は、フィルタースイッチが無効になるようになりました。

• 「子要素による一致」条件を使用したフィルターが設定されたLiveReportを複製すると、数秒後にフッターの件数に「0」と表示されていましたが、現在、複製されたLiveReportには正しいフィルター適用後の件数が表示されるようになりました。

• 下位構造の集計式列のスライダーは、その列が範囲クエリとしてフィルタリングされている場合でも移動できるようになりました。すべての行の値の計算が完了すると、その列の範囲が再計算されます。

スケッチャーズ

• 基本検索、詳細検索、および「フィルター」では、スケッチャーからモノマー構造を送信できなくなりました。これらは、送信されると自動的に低分子に変換されていたためです。モノマーがスケッチされている場合、「検索」および「追加」ボタンは使用不可となります。

• LiveReport からスケッチャーへエンティティをドラッグする操作が、プロジェクトダッシュボードに移動してから戻ってきた後も、ブラウザを更新しなくても機能するようになりました。この移動中にスケッチャーのフレームが再読み込みされると、スケッチャーが再同期されるようになりました。

• 「デザイン」パネルと「検索」パネルを切り替えると、スケッチされた構造 が消去されていましたが、現在はスケッチャーが低分子構造とモノマー構造の両方を保持するようになりました。

• ペプチドを右クリックして「Design Sketcherで使用」を選択すると、以前はエラーが発生していましたが、現在はDesign Sketcherでそのペプチドが開くようになりました。

• Design Sketcher を使って「化合物 」を追加すると、新しい行が選択されるものの、画面は最後から 2 番目の行までしかスクロールされませんでしたが、現在は新しい行が画面内に表示されるようになりました。

ライブレポート

• フィルタリング済みのLiveReportにSAR列を含むテンプレートを適用すると、「テンプレートの適用中」の状態で応答しなくなり、SAR列が追加されないことがありましたが、現在はSAR列を含めたテンプレートが速やかに適用されるようになりました。

• 「エンティティ」列でShiftキーを押しながらクリックすると、以前は最後にクリックした構造 のみが選択されていましたが、現在は構造の全範囲が選択されるようになりました。

• 行の右クリックメニューの下部にある「コピー先」や「名前を付けてエクスポート」などのオプションが、一部の行では表示が切れてしまっていたことがありましたが、現在はメニュー全体が表示されるようになりました。

• アトミックレンダリングでは表示できなかった生物学的エンティティは、アトミックレンダリングをオフにした後もファイルアイコンのプレースホルダーが表示されたままでしたが、現在は通常の画像に戻るようになりました。

• 他の場所で数式の値を編集したり列を追加したりといった変更を行った後、非アクティブなLiveReportタブに戻ると、以前は古いデータが表示されていましたが、現在は最新のデータが表示されるようになりました。

• LiveReportのピッカーは、特定のウィンドウ幅（特にEdgeでは）で表示が切れたり、正しく表示されなかったりすることがありましたが、現在はどのようなウィンドウサイズでもすべての列とボタンが表示されるようになりました。

• タイル表示では、3Dフリーフォーム列の「3Dで表示」アイコンが切り取られていて、3Dビジュアライザーを開くことができませんでしたが、現在はアイコンが完全に表示され、構造 が開くようになりました。

• LiveReportで長い列ヘッダー内のテキストを検索すると、以前はヘッダーが複数行に折り返されていましたが、現在は検索結果が表示されてもヘッダーは1行に収まるようになりました。

• 文字列内の区切り文字（「$」）の解析を修正し、エラーが発生して数式の保存が妨げられることがないようにしました。

• 「ユーザー」または「閲覧者」のロールを持つユーザーは、読み取り専用のLiveReport内でフリーフォーム列の値を編集できませんでしたが、現在は、フリーフォーム列自体が読み取り専用でない限り、それらを編集できるようになりました。

• エンティティの列にカスタムの「構造 」配置を設定しても、構造物の向きは変わりませんでしたが、現在は構造物が指定されたコアに合わせて配置されるようになりました。

• ロットが複数あるバイオ医薬品の場合、行単位（ロットごと）モードではアッセイのツールチップが表示されませんでしたが、現在はすべてのエンティティタイプにおいて、あらゆる行単位モードで表示されるようになりました。

• アッセイカラムの「カラム詳細」ダイアログには、ツールチップの「フィールドの設定」リンクとプロトコルの説明が表示されていませんでしたが、現在は両方が再び表示されるようになりました。

• アッセイセルのツールチップには、測定濃度の値や単位が表示されていませんでしたが、アッセイのツールチップ設定にそれらを含めることで、グリッド表示とタイル表示の両方で再び表示されるようになりました。

MPO

• MPO列を削除すると、LiveReportには新しく追加された構成要素の「望ましさ」列が残っていましたが、今回の変更により、MPO列とともにこれらの列も削除されるようになりました。

• 既存のMPOに構成要素を追加すると、以前は最初の「保存」時にエラーが表示されていましたが、現在は最初の試行で正常に保存されるようになりました。

• 既存のMPOに構成要素を追加すると、その新しい「望ましさ」列がLiveReportの最右端に配置され、MPOの他の「望ましさ」列と一緒にグループ化されるようになります。

• 未公開の列から作成されたMPOを含むLiveReportをコピーまたは複製したり、テンプレートとして保存したりすると、未公開の入力項目に対するチェックが省略され、スコアのないMPOや適性度列が生成される可能性がありました。現在、LiveDesign では、未公開のフリーフォームまたは数式入力列を公開するよう促すメッセージが表示されるか、またはそれらのMPOが削除されるまでLiveReportをコピーできないという警告が表示されます。

フォームのレイアウト

• 「マルチエンティティマトリックス」ウィジェット：SAR列の構造が小さすぎて読めなくなっていたため、セルに合わせてサイズが調整されるようになりました。

• フォームのレイアウトにおいて、エンティティ画像ウィジェットからドリルダウンするように設定されたウィジェットは、スプレッドシートからエンティティ画像自体をドリルダウンさせた場合にはデータが表示されませんでしたが、現在は選択されたエンティティのデータが表示されるようになりました。

• マルチエンティティ・マトリックス・ウィジェットで行または列の区切り線をドラッグすると、以前はエンティティの画像が選択されてしまいましたが、現在は行または列のサイズが変更されるようになり、サイズ変更やスクロール中もラベルやコンテンツの位置がずれることなく維持されるようになりました。

プロジェクトダッシュボード

• プロジェクトダッシュボードの「アクティビティ」タブで、「フリーフォームコメント」列名で検索しても結果が表示されませんでしたが、現在は、その列のコメントに限定してアクティビティがフィルタリングされるようになりました。

• ハイパー制限が適用されていない非グローバルプロジェクトの「アクティビティ」タブでコメントをフィルタリングする際、グローバルコメント欄が列名のドロップダウンメニューに表示されるようになりました。

• プロジェクトダッシュボードの「エンティティ」セクションでは、以前は、ステレオカテゴリやコメントのみが異なるなど、別の登録済み化合物 と構造 を共有する実際の化合物が除外されることがありましたが、現在はそれらすべてをカウントして一覧表示するようになりました。

• 公開済みのフリーフォームコメントの列を削除しても、これまでプロジェクトダッシュボードのアクティビティ列ピッカーやコメントストリームには表示され続けていましたが、これらは両方の表示から削除されるようになりました。

輸入・輸出

• .maegz ファイルから、すでに登録済みの汎用エンティティの「Maestro 」データをインポートする場合（例えば、LDClient の import_maestro_generic_entity メソッドを使用する場合など）、以前は 3D 列のみが追加されていましたが、これに伴い、3D 以外のプロパティ列も LiveReport に追加されるようになりました。

• Data Integrator を通じて読み込まれた TYPE 宣言ファイル（ADC など）を使用するユーザー定義クラスのジェネリックエンティティは、LiveReports で正常に登録され、そのクラスアイコンが表示されるようになりました。処理された `構造 ` にシリアル化された `構造` が含まれていない場合、登録時に `ld_generic_entity_structure` 行が書き込まれなくなりました。クラスアイコンは `ld_generic_entity_type` を通じてレンダリングされます。

• 1つの「フリーフォームコメント」列のセル内に複数のコメントがあるなど、セルのテキストが長いLiveReportsをPDFにエクスポートすると、テキストがセルからはみ出し、ページからはみ出して重なり合う現象が発生していましたが、現在はテキストがセルの端で切り詰められるようになり、セル内に収まるようになりました。

• 「その行のエンティティを処理するファイルがない」というエラーを報告する汎用エンティティのインポートエラーでは、以前は「Entry」列の行番号より1つ小さい行番号が表示されていましたが、現在は1を基点とする同じ行番号が表示されるようになりました。

残基 置換基とモノマー

• 残基 置換機能では、変異位置の値がテキストとして保存されるようになったため、単一の置換における整数位置は、もはや小数として表示されなくなりました。

• 残基 の置換ツールでは、別のLiveReportに切り替えてエンティティを再度読み込んだ後、[Chain]ドロップダウンがグレーアウトされていましたが、LiveReportを切り替えた際にツールがリセットされるようになったため、チェーンを選択できるようになりました。

• 残基 以前は、バッチ内のいずれかの置換が無効な場合、タスク全体が失敗として扱われていましたが、現在は有効な変異体を追加し、拒否された各置換をそのエンティティの失敗として報告するようになりました。

• 残基 の置換処理において、モノマーデータベースに存在しないモノマーIDが指定された場合、タスクエラーでは単にタスクが失敗したことを報告するだけでなく、その未知のモノマーの名称が表示されるようになりました。また、LDClientでも、このメッセージがAsyncServiceTaskFailedErrorに含まれるようになりました。

• 残基 の複数変異を含む置換結果において、「Parent」列が、セル内の「Mutation Chain」、「Mutation Position」、「Mutation From」、「Mutation To」の各値と揃うようになりました。これにより、各変異行が、その変異の由来となった親変異を表示するようになりました。

• 「Simple User」ロールのユーザーは、残基 の置換ツールを開いてエラーを確認することができましたが、現在は「残基 」の置換ツールおよびモノマーデータベースツールが「Simple User」には非表示となり、「Viewer」はこれらを利用できなくなっています。

• 「残基 」の置換ツールでは、置換対象の残基 と同じモノマーを選択するとタスクが失敗していましたが、現在、そのモノマーは置換リストで無効化されています。

• 残基 の置換処理によって単一のエンティティが作成された場合、通知文が「1つのエンティティが追加されました」ではなく、「LiveReportに1つのエンティティが追加されました」と表示されるようになりました。

反応の列挙

• 「リアクション一覧」パネル内のリアクションプレビューでは、以前はテキストが重なって読みづらかったのですが、現在ははっきりと表示されるようになりました。

• 「Reaction Enumeration」は、構造 を1つずつ処理するのではなく、構造を並列バッチで前処理することで生成物の登録を高速化します。社内テストでは、1000個の生成物を処理する場合、約18%高速化されました。登録の動作（エイリアス、重複排除、エラー報告）に変更はありません。

• 「反応列挙」で「New Sketch」を使用して描画された反応物は、生成物とともにLiveReportに表示されませんでしたが、現在はLiveReportに追加されるようになりました。

R-グループ の分解

• LiveReportにスキャフォールドを追加すると、ブラウザを更新するまで多くのR-グループ の分解セルが「保留中」の状態のままになっていましたが、現在は更新しなくても分解結果が表示されるようになり、新しく追加されたR-グループ の列でも同様に表示されるようになりました。

• R-グループ の分解ツールにおいて、「使用方法」＞「SAR分析」を選択しても、LiveReportの「Scaffolds」セクションが折りたたまれている場合、スキャフォールド・スケッチャーが開かず、エンティティをツールにドラッグしてもドロップターゲット が発生しませんでした。現在は、セクションの状態にかかわらずスケッチャーが開き、エンティティのドラッグを開始するとセクションが展開されるようになりました。

• R-グループ の列は、新しいスキャフォールドが追加された際、以下の順序で表示されるようになりました：一致したスキャフォールド、スキャフォールド名、そしてR基の昇順。

• 「プロジェクトのスキャフォールドを使用」を有効にすると、新しく追加された R-グループ 列が、ブラウザを更新するまで「保留中」の状態のままになることがありましたが、現在はこれらの列に R-グループ の画像がすぐに表示されるようになりました。

• 1つのLiveReportで公開済みのプロジェクト・スキャフォールドに変更が加えられても、ブラウザを更新するまでは他の開いているLiveReportのグリッドには反映されませんでしたが、現在は自動的に更新されるようになりました。

• LiveReport から低分子のジェネリックエンティティを R-グループ の分解パネルにドラッグしても、以前はスケルトンが作成・編集されませんでしたが、現在は化合物の場合と同様に、スケルトン編集用のスケッチャーが開くようになりました。

• R-グループ LiveReportに新たに追加された化合物の分解セルは、ブラウザを更新するまで「処理中」の状態のままになることがありましたが、現在は更新しなくても結果が表示されるようになりました。

• 管理者が立体化学、タウトマー、または芳香族性に関するサブ構造検索設定を変更した後、R-グループ の分解処理において、誤った立体異性体に一致した化合物など、古いスケルトン一致結果が引き続き表示されることがありました。これらの設定が変更された際、キャッシュされた一致結果はクリアされ、再計算されるようになりました。

• R-グループ の展開パネルで、スキャフォールドの並べ替え中にスキャフォールドの編集や追加が可能でしたが、リストに表示せずに保存できるようになっていました。現在、並べ替え中は編集機能が無効になっています。

あらすじ

• プロットの軸に使用された画像は、軸にカーソルを合わせると切り取られたり途切れたりして表示されていましたが、現在はすべてのプロットタイプで正しく表示されるようになりました。

• 軸上に R-グループ またはエンティティ画像を使用するプロットでは、以前は軸の周囲に大量の余白が生じていましたが、現在は画像とプロットが利用可能なスペースを埋め尽くすようになりました。

• データポイントからカーソルを離してもプロットのツールチップが画面に残ってしまうことがありましたが、現在は期待どおりに表示されなくなりました。

• 箱ひげ図のY軸の列を変更すると、以前はカスタムX軸の範囲がリセットされていましたが、現在は、各軸の列が変更されない限り、それぞれの軸がカスタム範囲を維持するようになりました。

• エクスポートされたPNGおよび SVG プロットでは、固定されたツールチップの接続線が誤った位置を指していましたが、現在は正しいデータポイントを指すようになりました。

• フォーム表示の「プロットのクイックオプション」で、列名が長すぎると表示範囲からはみ出し、2番目の列ピッカーが画面外に出てしまうことがありましたが、現在は列名が切り詰められるようになり、両方のピッカーにアクセスできるようになりました。

• 別のLiveReportのデータ系列を使用したボックスプロット、ヒストグラム、散布図は、タブを切り替えるまではアクティブなLiveReportのデータのみが表示されていましたが、現在はリフレッシュ後、両方のLiveReportのデータが即座に表示されるようになりました。

• プロットオプションにおいて、長い「色分け」列名のツールチップが「色分けルールの編集」ボタンを覆ってしまっていた問題が修正され、現在はボタンの下に表示されるようになりました。

• 「用量反応曲線」ツールの「オーバーレイ列」ドロップダウンは、以前は管理者が設定したアッセイ列フィルターを無視し、名前に「Curve)」を含む列のみを表示していましたが、現在は設定されたフィルターが適用されるようになりました。デフォルトでは引き続き「Curve)」を含む列のみが表示されますが、大文字小文字を問わず一致するようになりました。

• 「フォーム」ビューにおいて、ヒートマッププロットの列ドロップダウンにある検索ボックスは、他のプロットタイプとは異なる配色テーマが使用されていましたが、現在はそれらと統一されました。

• 「合計」や「中央値」などの2Dヒートマップの集計モードでは、以前は小数点以下10桁を超える値が表示されていましたが、現在は四捨五入された値が表示されるようになりました。

• 複数のエンティティを含む2Dヒートマップのセルにカーソルを合わせると、以前は最初のエンティティのツールチップのみが表示されていましたが、数値列で色分けした場合、現在は集計値が表示されるようになりました。

リガンド デザイナー

• リガンド デザイナー：選択済みの2つの原子のうち1つの選択を解除した後に、別の原子やフラグメントを追加すると、セッションが中断され、再起動時にリガンド が失われていましたが、現在はリガンド での編集が期待通りに動作するようになりました。

• リガンド Designerおよびリガンド のMinimizationでは、リガンド 名において化合物 IDの代わりに「undefined」と表示されていましたが、現在は化合物 IDの後に、参照先であるリガンド またはポーズ名が表示されるようになりました。

• リガンド デザイナー：ポーズを予測した後にポップアウトモードでセッションを開くと、キャンバスやオーバーレイが絶えずちらつくことがありましたが、現在はポップアウトが正しく表示されるようになりました。

• リガンド 設計者：最小化ワークフローに切り替えた直後にリガンド を最小化すると、リガンド が結合ポケットから外れてしまうことがありましたが、現在では最小化された姿勢がポケット内に留まるようになりました。

3Dビジュアライザー

• 3D添付ファイルの内容が同一（空のファイルなど）だったモデルの出力データでは、3Dビジュアライザーで同じエンティティの添付ファイルや別のエンティティの添付ファイルが読み込まれることがありましたが、現在は各構造 が独自の添付ファイルを読み込むようになりました。

• 3D Visualizerの階層構造において、3Dフリーフォームカラムおよび汎用エンティティに由来する構造が、モデル出力と同様に、エンティティIDヘッダーの下にグループ化されるようになりました。

• あるエンティティの複数のポーズが同じ3Dアタッチメントを共有していた場合、3Dビジュアライザーでは以前はそれらすべてに共通の名前が表示されていましたが、現在は各ポーズの固有の名前が表示されるようになりました。

シーケンスビューア

• 1つのシーケンスビューアで番号付け方式を変更すると、以前は選択された残基 がそのビューア内でのみクリアされていましたが、現在は同期されているすべてのシーケンスビューアおよび3Dビジュアライザーのインスタンスで選択がクリアされるようになりました。

• SEQUENCE_VIEWER_CUSTOM_MATRIX_FILE_UPLOAD_LIMIT で設定された制限をわずかに超えるカスタムマトリックスファイルでも、これまでシーケンスビューアにアップロードできていましたが、現在は他のファイルのアップロードと同様に、制限値が10進法のメガバイト（1 MB = 1,000,000 バイト）で測定されるようになったため、制限を超えるファイルは拒否されます。

• シーケンスビューア：残基 のフローティングツールチップが、開いているドロップダウンメニューの背後に隠れてしまうことがありましたが、現在はドロップダウンが開いていない場合にのみ表示されるようになりました。

• シーケンスビューアでは、選択したエンティティを読み込む際に、処理ステータスバーの横にライセンスエラーが表示されることがありましたが、現在は「スイートライセンスを確認中」というメッセージが表示され、ライセンスの確認が完了するまでエンティティの読み込みを待機するようになりました。

• シーケンスビューアで固定された参照配列は、以前は処理ステータスバーの上をスクロールしていましたが、現在はステータスバーの後ろに表示されるようになりました。

• シーケンスビューアの凡例において、「サイドチェーンの化学構造」、「ヘリックス」、「ストランド」、「ターン傾向」、「露出傾向」、および「立体化学的グループ 」の各カラースキームでは、これまで別個の「デフォルト」という項目を表示していたのに対し、現在は「傾向なし」など、デフォルトの色を説明的な名称で表示するようになりました。

• 残基 プロパティを使用してシーケンスビューアに色を付ける際、無効なファイルやJSON形式ではないファイルを含む列を使用すると、以前はスピナーが無限に表示されていましたが、現在はエラーアイコンが表示され、ツールチップに無効なファイルを持つエンティティの一覧が表示されるようになりました。

• シーケンスビューアのロゴプロットに表示される保存に関するツールチップには、核酸残基 が次のように記載されていました。 UNKと表示されていましたが、現在はそれらの残基 コードが表示されるようになりました。ただし、ウラシルについては依然としてXと表示されています。

LDClient &API

• LDClient：input_format を省略すると、bbchem_convert が 400 エラーで失敗していましたが、ドキュメントに記載されている通り、現在は入力形式を自動検出するようになりました。

• LDClientのAPI リファレンスにおいて、サイドバー内の長いメソッド名が、メインコンテンツにはみ出すことなく、改行されるようになりました。

• LDClientのupdate_monomerメソッドを使用して、カスタムモノマーのエイリアスのみを更新しても、そのモノマーのUPDATED_ATタイムスタンプは変更されませんでした。現在、UPDATED_ATにはエイリアスの変更が反映されるようになりました。

• エンティティ表現API から、MOL または MOL V3000 形式の小分子ジェネリックエンティティをリクエストすると、以前は空のレスポンスが返されていましたが、現在は MOL V3000 形式の構造 が返されるようになりました。

認証

• ログアウトして再度ログインすると、どのブラウザタブであっても最後に更新されたLiveReportが開いていましたが、現在は、そのタブで開かれていたLiveReportに戻るようになりました。

• Firefox でリフレッシュトークンの生成ページを開くと、以前はプロジェクトページにリダイレクトされたり、構文エラーが表示されたりしていましたが、現在はトークンが正しく表示されるようになりました。

管理パネル

• 管理パネルでプロトコルやモデルからプロジェクトを削除しても、子モデルやパラメータ化されたモデルからは削除されず、一貫性のない状態になっていましたが、現在は子モデルやパラメータ化されたモデルからもプロジェクトが削除されるようになりました。また、モデルからプロジェクトを削除する際、管理者には警告が表示されるようになりました。

システム状態診断ツール

• ツールウィンドウのサイズを変更した際に、「システムの健全性」ツールのツールチップが切り取られていましたが、現在は完全に表示されたままになります。